В 1943 г. образуется Ульяновская область, в целях проведения методической работы по гигиеническому обучению и воспитанию населения области создается областной Дом санитарного просвещения (ОДСП). Первоначально ОДСП располагался в здании областного отдела здравоохранения по адресу: ул. Гончарова, д. 22. В 1952 году ОДСП переезжает в здание первой городской детской поликлиники по адресу: ул. Гончарова, д. 53. В лечебных учреждениях области появились медицинские работники, отвечающие за организацию санитарно-профилактической работы.
В 1955 г. руководство областного отдела здравоохранения принимает решение выделить для ОДСП помещение по адресу: ул. Ленина, 69 (сейчас дом 73), где областной Дом санитарного просвещения находился более 30 лет. В разное время им руководили: Подпрятова Татьяна Владимировна (до 1957), Медведкова Фаина Михайловна (с 1957), Земченко Иван Андреевич (с 1970), Савельева Валентина Афанасьевна (с 1981), Хмелев Александр Иванович (с 1984), Гончаров Александр Васильевич (с 1985).
В 1988 году приказом Министерства здравоохранения СССР № 770 «О совершенствовании гигиенического воспитания населения и пропаганды здорового образа жизни» от 14.10.1988 служба санитарного просвещения была преобразована в службу здорового образа жизни, а дома санитарного просвещения (в том числе и ОДСП) – в Центры здоровья. Этот дом был центром санитарного просвещения в течение последующих сорока лет. В 1989 году ОДСП переименован в Центр здоровья.
Название «Ульяновский областной центр медицинской профилактики» (ГУЗ УОЦМП) было присвоено учреждению в 1993 году. Главными врачами ГУЗ «Ульяновский областной центр медицинской профилактики» были: Мальцев Михаил Александрович (с 1998), Макеев Дмитрий Александрович, Алимов Наиль Меулетович (с 2005), Мальцева Лариса Анатольевна, Продайвода Галина Егоровна (с 2009), Мулько Владимир Ильич (с 2010), Зулькарняев Шамиль Якубович (с 2012), Салихова Елена Абдрашитовна (с 2013), Смирнов Павел Сергеевич (с 2014). С 25 октября 2017 года ГУЗ «Ульяновский областной центр медицинской профилактики» руководит главный врач Караулова Валентина Герасимовна.
С мая 2005 года здание ГУЗ УОЦМП перешло в собственность заповедника «Родина В.И. Ленина», он переехал на территорию ГУЗ «Ульяновская областная клиническая больница».
В июне 2009 года он переезжает в здание Ульяновской областной медицинской библиотеки, расположенной на территории ГУЗ «Ульяновская областная клиническая больница» по адресу: ул. 3-го Интернационала, д. 1 (историческое здание «Дворянский вокзал»). В 2013 году ГУЗ «Центр общественного здоровья и медицинской профилактики Ульяновской области» переезжает в офисный центр по адресу: г. Ульяновск, ул. Спасская, д. 5. С 2019 года по настоящее время ГУЗ «Центр общественного здоровья и медицинской профилактики Ульяновской области» располагается по адресу: г. Ульяновск, ул. Гончарова, д. 4.
На сегодняшний день ГУЗ «Центр общественного здоровья и медицинской профилактики Ульяновской области» является основным координатором профилактической работы региона. Он контролирует работу центров здоровья, один из которых вошел в состав ГУЗ «Центр общественного здоровья и медицинской профилактики Ульяновской области», отделений и кабинетов медицинской профилактики, кабинетов здорового ребенка и отказа от курения, оказывает консультативную и методическую помощь.